科学では解決不能とされた事件簿=X‐ファイルを専門に扱うFBIの特別捜査官モルダーは、またもや不可解な事件に巻き込まれようとしていた。さびれた空気の漂う空軍駐屯地のある街で、ろくでなしの男たちが次々と殺される。「闇の中の木から手がはえてきた…」目撃者たちは、およそ常識では理解できない証言をするばかり。FBIで変人あつかいされるフォックス・モルダーは、合理的思考の美人パートナー、ダナ・スカリーをたよりに、事件の解明に乗り出すのだが…。全米で圧倒的な注目を浴びたX‐ファイルの知られざる事件簿。