バットマンに恨みを抱くトゥーフェイス/ハーヴェイ・デント（トミー・リー・ジョーンズ）は、街中で暴動を起こしていた。

一方、バットマン＝資産家ブルース・ウェイン（ヴァル・キルマー）の経営するウェイン・エンタープライズでは、エレクトロニクス部門の研究員エドワード・ニグマ（ジム・キャリー）が、テレビ信号を直接人間の脳に送る3Dホログラム装置「BOX」を開発する。しかし脳を人工的に操作するマインドコントロールには倫理上問題があると危惧して、ウェインは融資を拒否。失望して会社を辞めたニグマは、トゥーフェイスと組んで強盗で莫大な資金を調達し、ホログラム装置を量産する。ゴッサムシティーでは「BOX」が大ブームとなり、ニグマは大富豪となる。中古品のためノークレームノーリターンでどうぞよろしくお願いいたします。